“中心”实行理事会领导下的主任负责制，主任全面负责中心的建设和管理工作，由浙江财经大学具体执行协同创新中心建设的学术领军人才担任，设副主任两名，负责具体组织实施“协同创新中心”的日常工作。

首届中心主任和副主任名单如下：

主 任：赵海利

副主任：王序坤

副主任：朱晓艳

“中心”下设项目管理部、财务部、综合事务部，项目管理部主要负责项目的申报与研发、成果认定保护与转化推广，财务部主要负责资金管理，综合事务部主要负责人员的聘用与绩效管理、中心日常行政事务等。项目管理采用“首席专家责任制”。

“中心”下设4个项目部：

共同富裕理论研究

共同富裕政策成效评价

农村公共产品供给研究

扶持对象行为决策研究